Dinamica molecular Informatica

caver 3.0 Tunnels and channels

Tunnels and channels facilitate the transport of small molecules, ions and water solvent in a large variety of proteins. Characteristics of individual transport pathways, including their geometry, physico-chemical properties and dynamics are instrumental for understanding of structure-function relationships of these proteins, for the design of new inhibitors and construction of improved biocatalysts. CAVER is a […]

Dinamica molecular

¿Qué sabe Ud. Acerca de… Dinámica Molecular?

Laboratorio de Simulaciones Moleculares Computacionales, Facultad de Ciencias Químicas, BUAP ¿Qué sabe Ud. Acerca de… Dinámica Molecular? What do you know about… Molecular Dynamics? Preguntas 1. ¿Qué es la Dinámica Molecular? 2. ¿Qué tipo de información se requiere para realizar un estudio por Dinámica Molecular? 3. ¿Qué diferencia existe entre la Dinámica Molecular y otros […]

Dinamica molecular

Herramienta web para análisis de Dinámica molecular (DM): Modelo de electroporación de membranas celulares

  La simulación computacional de moléculas o estructuras biológicas es una poderosa herramienta que permite modelar aquellos fenómenos producidos en la experimentación de laboratorio. Las simulaciones in silico son un complemento para analizar los resultados obtenidos por otros métodos ya sea porque permiten simular escenarios que por su escala nanométrica son difíciles de analizar en […]

Dinamica molecular

Mecanica y dinamica molecular clasica

  La dinámica molecular (DM) es una técnica de simulación por computadora en la que se permite que átomos y moléculas interactúen por un período, permitiendo una visualización del movimiento de las partículas. Originalmente fue concebida dentro de la física teórica, aunque hoy en día se utiliza sobre todo en biofísica y ciencia de materiales. […]